Sergiu Ivanov

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===== Introduction à Cytoscape =====

Cette introduction vise à familiariser rapidement (un TP de 3 ou 4 heures) les étudiants avec l'usage de base de [[http://cytoscape.org/|Cytoscape]], un outil puissant d'analyse de réseaux biologiques. Les étudiants sont invités à suivre [[http://manual.cytoscape.org/en/stable/Basic_Expression_Analysis_Tutorial.html#basic-expression-analysis-tutorial|le tutoriel de Cytoscape]], puis l'un des [[http://manual.cytoscape.org/en/stable/Styles.html#styles-tutorials|tutoriels sur les styles]], et ensuite à utiliser Cytoscape afin d'analyser une voie de signalisation impliquée dans le cancer du sein et de formuler des conclusions non triviales.

Les slides (en anglais) définissant les objectifs de ce TP se trouvent {{:cytoscape-beam.pdf|ici}}. Ces slides ont distribuées sous la [[https://fr.wikipedia.org/wiki/Licence_Creative_Commons|licence Creative Commons Paternité]] {{:ccby.png?60}}.

Sergiu Ivanov

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